（1）职能管理。即根据国家在一定时期的方针政策及行政管理的需要，对各政府机构的职能进行配置、调整。其主要任务是：在拟定政府机构改革方案时，提出转变和调整政府职能配置体系的总体意见；在各部门实行“三定”时，合理配置各部门的职能；协调各部门之间的职责分工；协调同级政府部门与下级政府相关部门，以及与企业、事业单位、群众团体和其他国家机关之间的职责分工。
（2）机构管理。即对机构设置与调整的管理，具体包括机构设置的名称、性质、级别、规模·序列、层次、数量等多方面的内容·其中政府机构的名称一般包括域名（表明地理位置或管理范围）、矢名（表明管理内容）和格名（表明规格级别）三项内容，分别说明这些机构的管理范围、隶属关系、管理内容及机构层次。如某市政府部门名为“某某市民政局”,此处的“某某市”表明了其所处的位置和管理范围，“民政”表明了其管理内容，“局”则表明了其机构的地位。目前，我国政府机构的格名主要有“政府”、“部”、“委员会”、“署”、“行”、“局”、“厅”、“处”、“室”、“科”等。
（3）人员编制管理。即对机构中的人员总额、人员结构、职位配置等方面的管理。
